Расшифровка геномной "тёмной материи"

Учёные из Университета Торонто раскрыли некоторые секреты того, что молекулярные биологи называют транскриптами "тёмной материи". Результаты будут опубликованы на следующей неделе в открытом онлайн-журнале PLoS Biology.

Термин "тёмная материя" относится к геномной продукции, которая не происходит от известных генов, а возникает из областей, ранее считавшихся "мусорной ДНК". Когда из этих областей были обнаружены генетические сигналы (транскрипты РНК), возникло предположение о новой загадке.

Однако новое исследование под руководством постдока Харма ван Бакеля и профессора Тимоти Хьюза показывает, что большинство этих сигналов, вероятно, являются побочными продуктами активности уже известных генов. Остальные сигналы больше соответствуют фоновому шуму, чем осмысленным данным.

Часть загадки была связана с методологией. Многие первоначальные сообщения о сигналах "тёмной материи" использовали "тайлинг-микрочипы", которые, как выяснили исследователи, создавали множество ложноположительных результатов. Используя современный метод секвенирования большого числа транскриптов, они установили, что необъяснимая "тёмная материя" составляет лишь 2% от общего числа транскриптов — значительно меньше, чем считалось ранее. Большая часть этих 2% находится очень близко к известным генам, что указывает на их связь с самими генами.

"Тот факт, что большинство транскриптов "тёмной материи" можно связать с известными генами, говорит о том, что они не являются сигналами из скрытой вселенной внутри генома", — говорит ван Бакель. — "Хотя пока рано полностью исключать какую-либо функциональную роль, эти транскрипты, вероятно, в основном являются побочными продуктами нормальной экспрессии генов".

"Учитывая размер человеческого генома, важно знать, на чём сосредоточить внимание", — добавляет учёный. — "До сих пор мы не могли знать, упускаем ли мы ключевую биологическую информацию. Это открытие позволяет нам сфокусироваться на том, что действительно важно".