Расшифровка генома утки проливает свет на борьбу с птичьим гриппом

Консорциум по геному утки, в который вошли ученые из Китайского сельскохозяйственного университета, BGI, Эдинбургского университета и других институтов, завершил секвенирование и анализ генома утки (Anas platyrhynchos) — одного из основных природных хозяев вирусов гриппа А, вызвавших новую эпидемию в Китае с февраля этого года. Работа выявила важные закономерности и предоставляет бесценный ресурс для изучения механизмов взаимодействия между хозяином и вирусами гриппа.

Новый штамм птичьего гриппа H7N9 привел к гибели 36 человек и экономическим потерям Китая в $6,5 млрд. Утка, как природный хозяин вирусов гриппа А (включая H5N1), часто остается бессимптомной при инфекции. Чтобы раскрыть механизмы взаимодействия, исследователи секвенировали геном 10-недельной самки пекинской утки и провели транскриптомные исследования на двух утках, инфицированных вирусом.

Впервые была получена черновая последовательность генома водоплавающей птицы — утки. Данные показали, что утка, как курица и зебровая амадина, обладает сокращенным репертуаром иммунных генов по сравнению с млекопитающими, а также содержит новые гены, отсутствующие у трех других птиц (курицы, зебровой амадины и индейки).

Сравнивая экспрессию генов в легких уток, инфицированных высоко- или слабопатогенными вирусами птичьего гриппа H5N1, команда выявила гены, чьи паттерны экспрессии менялись в ответ на вирусы. Также были идентифицированы факторы, потенциально участвующие в иммунном ответе утки на инфекцию, включая семейства генов α- и β-дефензинов птиц и млекопитающих.

Цзяньвэнь Ли, руководитель проекта из BGI, отметил: «Это исследование предоставляет очень важные данные для лучшего понимания взаимодействия между хозяином и вирусом птичьего гриппа. Ученые смогут глубже изучить механизмы распространения и заражения птичьим гриппом».