USDA-ARS выпускает геном прожорливой саранчи пустынной

Учёные из Службы сельскохозяйственных исследований Министерства сельского хозяйства США (USDA-ARS) впервые создали высококачественный геном саранчи пустынной — самого разрушительного мигрирующего насекомого в мире.

Геном саранчи пустынной (Schistocerca gregaria) огромен: почти 9 миллиардов пар оснований, что почти в три раза больше человеческого генома.

Работа от сбора образца до финальной сборки генома заняла менее 5 месяцев. Геном был собран из ДНК одной особи саранчи, что стало возможным благодаря современным технологиям секвенирования. Эту особь с известной родословной получили от химического эколога Baldwyn Torto из Международного центра физиологии и экологии насекомых (ICIPE) в Найроби, Кения.

Размер хромосом саранчи поражает: многие из них больше, чем весь геном плодовой мушки Drosophila melanogaster — первого собранного генома насекомого.

Геном стал доступен международному научному сообществу через Национальный центр биотехнологической информации (NCBI).

Нашествия саранчи пустынной носят циклический характер и фиксируются с древних времён. В последние десятилетия крупные вспышки происходили в 1967–1969, 1986–1989 и 2020–2022 годах, опустошая Восточную Африку, Ближний Восток и Юго-Западную Азию.

Ущерб от саранчи колоссален. По данным ФАО ООН, небольшой рой за день съедает столько пищи, сколько нужно, чтобы прокормить 35 000 человек.

Текущие методы борьбы в основном зависят от обнаружения стай и их обработки пестицидами широкого спектра действия. Наличие высококачественного генома — большой шаг к поиску целевых методов контроля. Эта работа также даст ценную информацию о родственных видах-вредителях, таких как сверчок мормонский.

Исследование является частью инициативы Ag100Pest, программы ARS по созданию высококачественных геномов для 100 главных членистоногих вредителей сельского хозяйства.

Пять фактов о саранче пустынной

• Это вид короткоусых прямокрылых, который периодически меняет форму тела, поведение и скорость размножения в ответ на условия окружающей среды.
• Термин "плуг" (plague) — технический. Он обозначает максимальную по интенсивности и масштабу фазу нашествия.
• Стаи могут долго находиться в воздухе, преодолевая до 1000 км за неделю и пересекая моря.
• Рой площадью один квадратный километр может содержать до 80 миллионов взрослых особей.
• Каждое новое поколение в рое может быть в 20 раз больше предыдущего.