Новая онлайн-база данных фокусируется на геноме через призму молекулярной структуры

Исследователи из Университета штата Айова создали доступную онлайн-базу данных, которая позволяет быстро получать критически важную геномную информацию.

В статье, опубликованной в журнале Scientific Reports, представлена новая база данных, дающая ученым быстрый доступ к информации о структурах РНК, закодированных в человеческом геноме. База данных находится в свободном доступе в интернете и позволяет изучать функции и структуру РНК с большей скоростью и простотой, чем раньше. Это облегчит фундаментальные исследования в области биологии человека и может проложить путь к новым методам лечения, нацеленным на РНК.

РНК (рибонуклеиновая кислота) — это молекулярные цепи, которые транскрибируются (копируются) с генома. В отличие от ДНК, РНК может «сворачиваться» сама на себя, образуя сложные структуры. Это сворачивание играет ключевую роль в функции РНК, поэтому информация о её структуре важна для понимания работы организмов.

Хотя только около 2% из 3.5 миллиардов пар оснований человеческой ДНК кодируют белки, более 70% транскрибируется в РНК. Понимание функций этого океана неизученной РНК — ключевая научная задача, и новая база данных предоставляет важные инструменты для её решения.

Исследователи фрагментировали весь человеческий геном на более чем 154 миллиона перекрывающихся окон и вычислили ряд показателей, ценных для понимания того, как сворачивается РНК. Теперь любой пользователь может получить за один клик данные, на расчёт которых раньше уходили часы.

РНК-терапия, новый подход в медицине, нацеленный на РНК, а не на белки, показывает большие перспективы. Новая база данных структур представляет собой огромный репозиторий потенциальных терапевтических мишеней.