Ученые представили почти полную версию генома мха Physcomitrium patens

Модельный организм Physcomitrium patens (ранее Physcomitrella patens) внес значительный вклад в понимание эволюции и развития растений. Однако известный на сегодняшний день геном этого мха содержит множество неполных или ошибочных регионов.

Международная исследовательская группа, включая ученых Фрайбургского университета, представила новую, почти полную версию генома. Среди прочего, было установлено, что геном мха содержит 26 хромосом, а не 27, как предполагалось ранее.

«Будущие исследования эволюции структуры хромосом выиграют от наших данных», — говорит профессор клеточной биологии Штефан Ренсинг, соавтор исследования. Результаты опубликованы в журнале Nature Plants.

В эволюционном плане линия мхов (Bryophyta) отделилась от линии сосудистых растений около 500 миллионов лет назад. Сравнение характеристик представителей этих двух основных линий наземных растений позволяет делать выводы о свойствах первых наземных растений, существовавших до эволюционного разделения. Однако для этого необходимы максимально точные данные. «Чем лучше референсный геном, тем лучше анализ», — отмечает Ренсинг.

Приобретенные и утраченные гены

Новая версия генома позволит с большей уверенностью определять, какие гены у мхов были приобретены, а какие утрачены по сравнению с цветковыми растениями. В конечном итоге это поможет лучше понять эволюцию структуры хромосом (центромер, теломер и консервативных последовательностей генов) у наземных растений в целом.

В работе использовались методы сравнительной геномики, филогении, анализа синтении и анализа предкового состояния.