Два участка генома собак объясняют треть риска редкого рака крови

Мутации в двух генетических областях у собак объясняют более трети риска развития агрессивной формы гематологического рака. К такому выводу пришло исследование под руководством Жаклин Эванс и Элейн Острандер из Национального института исследования генома человека в Мэриленде, США. Работа, в которой для изучения гистиоцитарной саркомы у ретриверов были объединены несколько методов секвенирования, опубликована 13 мая в открытом журнале PLOS Genetics.

Генетические локусы риска

Гистиоцитарная саркома — это агрессивный рак иммунных клеток. Хотя у людей он встречается крайне редко, им страдает примерно каждый пятый прямошёрстный ретривер. Полногеномный поиск ассоциаций с участием 177 больных и 132 здоровых прямошёрстных ретриверов выявил два локуса, связанных с этой болезнью: на хромосомах 5 (CFA5) и 19 (CFA19) собачьего генома.

• Локус CFA5 содержит мутации рядом с известным геном-супрессором опухолей PIK3R6. Он также перекрывается с двумя локусами, ранее связанными с другими гематологическими раками у золотистых ретриверов.
• Локус CFA19: было обнаружено, что варианты риска в этом локусе повышают экспрессию гена TNFAIP6, который участвует в метастазировании клеток. Этот ген также ранее ассоциировался с плохим прогнозом при нескольких видах рака у человека.

Сила генетического эффекта

Вместе эти два хромосомных региона объясняют 35% риска развития гистиоцитарной саркомы у прямошёрстных ретриверов. Авторы отмечают, что это исключительно сильный эффект для такого сложного признака.

Значение для медицины

Изучая этот редкий рак у домашних собак, которые имеют высокий риск заболевания и сравнительно низкое генетическое разнообразие, исследователи надеются выявить гены-кандидаты для разработки новых методов диагностики и терапии для людей.

"Эта работа определяет два участка генома, которые увеличивают вероятность развития гистиоцитарной саркомы у прямошёрстного ретривера, и выделяет гены с функциями супрессоров опухолей в каждом регионе. Стратегическое разведение может быть использовано для снижения частоты заболевания со временем, а генетические наблюдения могут привести к терапевтическим вариантам для собак и людей", — добавляет Элейн Острандер.