Генетический штрихкодирование сканирует морские виды на наличие вредителей

Справочная коллекция потенциально инвазивных морских видов в Западной Австралии (WA), являющаяся частью системы идентификации вредителей по их генетическому материалу, признана мировым прорывом в морской биобезопасности.

Ученые отдела биобезопасности Департамента рыболовства WA доктора Майкл Сноу, Джастин Макдональд и Жоана Диаш собрали 73 из 79 чужеродных видов из "Списка предотвращения интродуцированных морских вредителей WA" в эту справочную коллекцию в рамках более широкого пилотного проекта.

Создание каталога позволило исследователям определить уникальные генетические штрихкоды этих видов и разработать чувствительные ДНК-методы для поддержки их раннего обнаружения.

Интродуцированные морские вредители попадают в воды WA с балластными водами, на корпусах, канатах и якорях судов и могут нанести ущерб рыболовству, аквакультуре и туризму, вытесняя аборигенные виды.

Доктор Сноу отмечает, что искоренить инвазивных морских вредителей после их укоренения невозможно или очень дорого, поэтому инновационные методы защиты и обнаружения имеют решающее значение.

ДНК-технология обнаружения была внедрена в установочные массивы (settlement arrays), развернутые в Олбани, на острове Барроу и в Хилларисе в августе и сентябре. Эти устройства, предоставляющие субстрат для оседания морских организмов, будут извлекаться и анализироваться с различными интервалами до завершения проекта в январе.

Эта система позволит сотрудникам Департамента рыболовства WA в будущем гораздо эффективнее обнаруживать, идентифицировать и отслеживать интродуцированных морских вредителей.

"У нас есть список вредителей со всего мира, которые, как мы опасаемся, могут попасть в WA, и, создав их генетический профиль, мы сможем с уверенностью идентифицировать их в будущем, если они появятся", — говорит доктор Сноу.

Он также добавляет: "Мы надеемся, что связывание подхода секвенирования нового поколения с существующими технологиями отбора проб, такими как установочные массивы, повысит чувствительность и оперативность обнаружения и идентификации морских вредителей на ранней и потенциально управляемой стадии их инвазивного процесса".

Исследователи сотрудничают с учеными из лаборатории Trace and Environmental DNA Университета Кертина, профессором Майком Бансом и доктором Майклом Статом, для разработки передовых инструментов метабаркодирования.

Метабаркодирование — это метод оценки биоразнообразия, который использует одновременное определение всех последовательностей ДНК-штрихкодов в образце для подтверждения присутствия или отсутствия конкретных видов.

Доктор Сноу называет захватывающим достижением в области биобезопасности переход от обнаружения и идентификации одного организма к одновременному анализу множества организмов, например, при работе со смешанным образцом окружающей среды с установочного массива или сваи.