Генетическая карта поможет восстановить популяцию озёрной форели

Учёные расшифровали генетический состав озёрной форели (Salvelinus namaycush). Это достижение должно помочь усилиям по восстановлению популяций этой ценной рыбы в Великих озёрах и других водоёмах Северной Америки, где её численность резко сократилась из-за инвазивных видов, перелова и загрязнения.

Исследователи из США и Канады завершили работу над референсным геномом, или цифровой генетической картой, озёрной форели. Она поможет объяснить характеристики, позволившие виду эволюционировать и распространиться по обширному ареалу, где отдельные типы лучше приспособились к конкретным местам обитания и глубинам.

Эти данные также предоставят важную информацию для программ зарыбления водоёмов молодой форелью для дополнения естественного воспроизводства.

"Озёрная форель широко распространена по всей Северной Америке, и существуют огромные различия в использовании среды обитания, форме, размере, массе тела, окраске", — говорит Марк Гейден, представитель Комиссии по рыболовству Великих озёр, американо-канадского агентства, финансировавшего исследование. — "Нам нужно понять, почему они выглядят именно так, почему одни типы более успешны в одних местообитаниях, чем другие, почему одни типы в инкубаториях чувствуют себя лучше других".

Команда экспертов из нескольких университетов и государственных агентств США и Канады опубликовала отчёт о геноме 5 августа в журнале Molecular Ecology Resources. Уильям Тейлор, председатель комиссии по рыболовству и эколог-ихтиолог из Университета штата Мичиган, назвал это "жизненно важным недостающим звеном в наших усилиях по восстановлению озёрной форели".

Озёрная форель долгое время доминировала в Великих озёрах как хищная рыба и распространена в других крупных североамериканских озёрах. Она поддерживала жизнь коренных племён на протяжении поколений и была основной целью коммерческого рыболовства после заселения этих территорий.

Их численность в Великих озёрах резко упала в прошлом веке из-за вторжения морской миноги, паразита, похожего на угря, который прикрепляется к рыбе и высасывает её телесные жидкости. Исследователи в итоге разработали яд, который применяется в реках-притоках, где нерестится минога, сдерживая её численность.

Однако потеря среды обитания, перелов, загрязнение и другие инвазивные виды препятствовали усилиям по возвращению озёрной форели. Хотя они могут жить десятилетиями, половой зрелости они достигают примерно к семи годам — и многие не доживают до репродуктивного возраста.

Агентства продолжают зарыблять ею все Великие озёра, кроме озера Верхнее, где популяция хорошо восстановилась.

Создание референсного генома должно помочь менеджерам тонко настроить эти усилия. "Чем больше вы понимаете, как функционирует этот организм, тем больше можете сделать для его реабилитации", — отмечает Гейден.

Геномы лососёвых, семейства, включающего озёрную форель, сложнее собрать, чем у многих других животных, заявила исследовательская группа.

"Наличие общедоступной карты генома озёрной форели устраняет большинство первоначальных препятствий, связанных с проведением природоохранных геномных исследований, значительно облегчает сравнение результатов между исследованиями и, надеюсь, ускорит темп научных открытий", — сказал Сет Смит из Университета штата Мичиган, ведущий автор исследования.

Возвращение озёрной форели к её исторически влиятельной роли в Великих озёрах потребует понимания различий между её типами на уровне подвидов — что и поддержит геномное исследование.

"Мы видим их в разных средах обитания, функционирующих экологически разными способами, живущих по-разному", — говорит Шон Ситар, биолог-исследователь рыбного хозяйства из Департамента природных ресурсов Мичигана, не участвовавший в исследовании. — "Если вы хотите восстановить лесную экосистему, вы не сажаете одно дерево. Вы хотите восстановить целостность исходной экосистемы".