Вычислительная модель связывает родственников с помощью генеалогических и полицейских баз данных

Исследователи сообщают о вычислительном методе, позволяющем связывать людей из генеалогических баз данных с теми, кто находится в полицейских базах. Эти базы используют совершенно разные системы генетических маркеров.

Ключевой результат: В доказательство концепции на выборке из 872 человек показано, что для близких родственников (сиблингов или пар родитель-потомок) более 30% могут быть точно сопоставлены с правильным родственником, даже при использовании неперекрывающихся генетических маркеров из двух разных баз.

Разница в системах:

• Полицейская база (CODIS, FBI) использует маркеры коротких тандемных повторов (STR) в некодирующих областях ДНК (изначально 13 маркеров, сейчас 20).
• Генеалогические базы анализируют однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) в сотнях тысяч участков генома.

Принцип работы метода: Каждый STR-маркер окружен SNP, которые обычно наследуются вместе с ним. Генотип человека по этим SNP может частично предсказать генотип соседнего STR, и наоборот. Накопление этих корреляций по многим STR позволяет сопоставить SNP-профиль с STR-профилем.

Значение исследования:

• Показывает, что "наследственная проблема" старых полицейских баз данных (STR) может быть частично преодолена для поиска родственников.
• Расширяет возможности расследований: появляется теоретическая возможность связывать профили в CODIS с родственниками в генеалогической базе и наоборот.
• Поднимает важные вопросы политики, этики и приватности, поскольку ранее такая связь между разными типами баз считалась невозможной.

Другие потенциальные применения:

• Экология: отслеживание происхождения организмов в дикой природе, даже если старые образцы содержат только STR-данные.
• Археология: связывание фрагментов ДНК древних людей, например, из одного места захоронения.