Открытие первого гена на зародышево-ограниченной хромосоме зебровых амадин

Исследователи из Американского университета впервые идентифицировали ген на загадочной зародышево-ограниченной хромосоме (germline-restricted chromosome, GRC) у зебровых амадин.

Ключевое открытие

• У зебровых амадин в репродуктивных (зародышевых) клетках существует дополнительная хромосома (GRC), в то время как в соматических клетках их 40.
• Используя методы секвенирования генома и вычислительной биологии, команда выделила из 167 929 цепочек РНК первый ген на этой хромосоме.
• Ген назвали GRC α-SNAP. Он принадлежит к семейству SNAP, чьи белки играют ключевую роль в слиянии мембран в нейробиологии и других процессах.

Дополнительные результаты

• Исследование помогло заполнить пробелы в геноме зебровой амадины, секвенированном в 2010 году. Было идентифицировано 936 отсутствовавших белков.
• Зебровая амадина стала первым известным организмом с дупликацией гена из семейства SNAP.
• Эволюционный анализ показал, что ген GRC α-SNAP подвергался позитивному отбору, что указывает на эволюцию в сторону новой функции.

Значение и перспективы

Ген GRC α-SNAP присутствует только в зародышевой линии, что сразу предполагает его потенциальную роль в репродукции. Это открытие поднимает вопросы о половом определении у птиц, у которого нет четкого генетического детерминанта.

«Открытие GRC α-SNAP заставляет задуматься о том, что определяет пол у зебровых амадин, и о возможности, что этот ген является частью того, что делает самку самкой», — говорит руководитель исследования Джон Брахт.

Следующие шаги включают секвенирование ДНК GRC и изучение функций нового гена.

Исследование опубликовано в журнале Current Biology.