Новый тест на подлинность древней ДНК ставит под сомнение торговлю пшеницей в каменном веке

Образец ДНК, который, как считалось, свидетельствует о доисторической торговле злаками, скорее всего, происходит от современной пшеницы. К такому выводу пришли учёные из Института биологии развития Общества Макса Планка, разработавшие новый тест для проверки подлинности древней ДНК.

Тест был применён к образцу из затопленных отложений у острова Уайт. Ранее считалось, что он доказывает существование торговли между английскими охотниками-собирателями и более развитыми неолитическими земледельцами Европы 8000 лет назад. Новый метод, описанный в журнале eLife, показал, что возраст образца не превышает нескольких сотен лет.

Как работает метод

Исследователи разработали метод, основанный на биохимических изменениях, которые накапливаются с возрастом и характерны именно для древней ДНК. Эти изменения приводят к тому, что один из "строительных блоков" — цитозин (C) — считывается как тимин (T). Новый метод надёжно определяет, соответствует ли повреждение ДНК древнему или современному паттерну таких C-to-T изменений. Тестирование британских последовательностей пшеницы этим подходом показало, что их паттерн повреждения ДНК не соответствует ожидаемому для древней ДНК.

Проблема контаминации

Работа с древней ДНК сложна. ДНК может сохраняться веками или даже тысячелетиями, но она фрагментируется и присутствует в ничтожных количествах. Эти следы легко теряются при загрязнении образца современной ДНК из окружающей среды или от самих исследователей.

"Современная ДНК может легко загрязнить ценные образцы, поэтому крайне важно иметь гарантии подлинности исторической ДНК. Только тогда эти молекулярные сокровища смогут рассказать истории, раскрывающие прошлое", — говорит первый автор работы Клеменс Вайс.

Новый вычислительный метод позволяет аутентифицировать древнюю ДНК даже при извлечении минимальных её количеств, проверяя соответствие паттерна повреждения ожидаемому для древнего материала.

"Поскольку всё больше учёных входят в область исследований древней ДНК из окружающей среды и метагеномики, становится всё более важным установить определённые стандарты для оценки и интерпретации данных", — отмечает ведущий автор Эрнан Бурбано.

"Древняя ДНК позволяет нам заглянуть в эволюцию и экологию как растительных, так и животных видов, иногда раскрывая детали человеческой истории. Мы надеемся, что наш новый метод — это шаг к надёжному и успешному извлечению и интерпретации этих окон в прошлое", — заключает Бурбано.