Новый ДНК-тест для определения возраста рыб без вреда для них

Исследователи разработали быстрый и экономичный ДНК-тест для нелетального определения возраста трех уязвимых австралийских пресноводных видов: рогозуба (Australian lungfish), муррейской трески (Murray cod) и трески Мэри-Ривер (Mary River cod). Метод можно адаптировать и для других видов рыб.

Почему это важно:

• Возрастной состав популяции критически важен для управления: установления устойчивых норм вылова, оценки риска вымирания, понимания роста и размножения.
• До сих пор не существовало практического нелетального метода определения возраста для большинства животных, включая рыб (традиционный метод требует умерщвления рыбы для подсчета годовых колец в отолитах — ушных костях).

Как работает метод:

Тест основан на анализе метилирования ДНК в определенных участках генома — CpG-сайтах. Эта система оказалась консервативной: она работает как у модельных рыбок данио-рерио (zebrafish), так и у рогозуба, несмотря на более чем 100 миллионов лет эволюционного разделения. Метод был откалиброван на рыбах известного возраста с использованием датирования чешуи по радиоуглероду (bomb radiocarbon dating) и данных по отолитам.

Значение для науки и охраны природы:

• Доктор Бен Майн (CSIRO): Метод поддержит проекты по сохранению и устойчивому рыболовству во всем мире.
• Доктор Дэвид Робертс (Seqwater): Для рогозуба это прорыв, который улучшит понимание динамики популяции и усилия по сохранению.
• Том Эспиноза (Правительство Квинсленда): Нелетальное определение возраста создает основу для применения техники к другим видам и улучшения управления рыбными ресурсами.

Контекст:

Исследование является частью работы CSIRO по использованию ДНК для мониторинга окружающей среды, включая оценку продолжительности жизни позвоночных и изучение биоразнообразия по eDNA.

Статья "Non-lethal age estimation of three threatened fish species using DNA methylation: Australian lungfish, Murray cod, and Mary River cod" опубликована в журнале Molecular Ecology Resources.