Разработка новых методов судебно-медицинской экспертизы ДНК человека
Университет Сэма Хьюстона (SHSU) получил грант от Национального института юстиции (NIJ) на разработку и тестирование оптимальных методов подготовки образцов из скелетных и разлагающихся останков человека с использованием технологии секвенирования нового поколения (next generation DNA) для идентификации пропавших без вести или жертв массовых катастроф.
Шери Хьюз-Стамм из Департамента судебной науки SHSU и Брюс Бадоули из Института прикладной генетики (IAG) при Научном центре здоровья Университета Северного Техаса (UNTHSC) исследуют лучшие методы экстракции ДНК из разложившихся останков для секвенирования нового поколения. Новая технология, называемая массовым параллельным секвенированием (massively parallel sequencing, MPS), является наиболее продвинутым инструментом в области судебной биологии и может предоставить больше информации из каждого образца ДНК, включая идентификацию и происхождение.
"Массовое параллельное секвенирование обеспечивает более глубокий анализ ДНК и может дать больше информации в случаях с пропавшими без вести или массовыми катастрофами, когда идентификация с использованием обычных методов не удается", — сказала Хьюз-Стамм.
Исследование сосредоточено на определении наиболее эффективных методов подготовки образцов, которые максимизируют качество и количество ДНК для секвенирования, и разработке оптимальных стратегий интерпретации огромного массива данных, получаемых с помощью MPS-панелей для судебной идентификации.
В настоящее время ДНК-идентификация останков человека выполняется с использованием референсных образцов от близких родственников или прямого сравнения с личными вещами жертвы. Однако родственники могут быть не найдены, а индивидуальные образцы ДНК могут быть ненадежными.
Новые системы MPS позволяют анализировать большее количество и более мелкие генетические маркеры в каждом образце, даже сильно деградировавшем, тем самым повышая вероятность успешной идентификации погибшего. Поскольку MPS представляет собой фундаментальный сдвиг в химических процессах идентификации, могут потребоваться новые процедуры для получения достаточно чистой ДНК перед секвенированием.
Исследование, которое будет проводиться в течение двух лет, будет использовать тела с Юго-Восточного Техасского центра прикладной судебной науки (одного из всего шести "ферм тел" в стране) для тестирования лучших методов экстракции ДНК. В настоящее время для судебных применений представлены две разные платформы MPS, и SHSU, и UNTHSC имеют по крайней мере по одной из машин, что позволяет анализировать их одновременно. Кроме того, UNTHSC обрабатывает большинство случаев идентификации пропавших без вести не только для штата Техас, но и для всей территории США.
Тестирование новой технологии начнется с использования текущих методов ДНК-тестирования на сложных биологических образцах, чтобы затем сравнить результаты при использовании двух платформ MPS.
Новый грант NIJ следует за другим исследованием, проведенным для этого агентства в Университете Сэма Хьюстона, в котором изучались новые методы сохранения образцов тканей и ускорения процесса идентификации после массовых катастроф, таких как ураганы, цунами, теракты, войны или акты геноцида.