Новый светоуправляемый инструмент CRISPR повышает точность генетических исследований

Исследователи из Каролинского института разработали новый метод BLU-VIPR, позволяющий управлять системой редактирования генов CRISPR с помощью света. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.

Традиционные методы не позволяли с достаточной точностью модифицировать гены в конкретных областях организма в заданное время. BLU-VIPR решает эту проблему, позволяя активировать редактирование только в той анатомической области (например, в лимфатическом узле), на которую направлен свет.

"Наш новый инструмент для светоиндуцированного CRISPR позволит исследователям гораздо точнее понять биологическую роль генов, что, в свою очередь, увеличит наше понимание биологических процессов", — говорит Александр Эспиноза, последний автор статьи.

Как работает система:

• Учёные создали мощный светоиндуцированный фактор транскрипции VPR-EL222, объединив бактериальный белок (EL222) с доменом активации транскрипции (VPR).
• Под воздействием синего света этот фактор индуцирует направляющую РНК (gRNA) в клетках.
• gRNA связывается с белком Cas9, что приводит к редактированию выбранных генов.

Экспериментальные результаты:

• Система успешно использована для нокаута генов, их активации и точного редактирования оснований в клетках in vitro.
• Светоиндуцированная система CRISPR была доставлена с помощью вирусных векторов в первичные T-клетки.
• В лимфатических узлах мышей удалось добиться светоиндуцированного нокаута генов в T-клетках.

В дальнейшем команда планирует усовершенствовать систему для нацеливания на гены в других иммунных клетках, помимо T-клеток. Это открывает новые возможности для изучения иммунных реакций и механизмов заболеваний.