CRISPR как устройство записи

Исследователи из Гарвардского университета предложили использовать систему CRISPR/Cas в качестве своеобразного записывающего устройства, которое фиксирует, когда и где бактерия сталкивалась с различными вирусами. Результаты работы опубликованы в журнале Science.

CRISPR/Cas — это естественная иммунная система бактерий. При атаке вируса она вырезает фрагменты вирусной ДНК (олигомеры) и встраивает их в собственный геном, создавая «библиотеку» для борьбы с будущими инфекциями.

Ключевые моменты исследования:

• Учёные использовали упрощённый штамм E. coli, содержащий только ферменты Cas1 и Cas2 (для вырезания и встраивания олигомеров).
• Бактерию последовательно подвергали воздействию различных ДНК-последовательностей.
• Последовательность встраивания олигомеров в геном формировала временную запись о «вирусных атаках», которую можно прочитать с помощью секвенирования.
• Используя модифицированные версии Cas1 и Cas2, исследователи смогли создать разные «режимы записи».

Потенциальное применение:

Это открытие может помочь в создании бактериальных сенсоров, которые будут фиксировать присутствие различных микроорганизмов в окружающей среде. Такие сенсоры могут быть полезны для анализа почвы, изучения микробиома кишечника человека или в атмосферных зондах.