CAGE-Proxvivo: Универсальная активация белков в живых мышах с помощью ИИ
Исследователи из Пекинского университета под руководством профессоров Чэнь Пэна и Ван Чу разработали стратегию CAGE-Proxvivo. Это компьютерно-вспомогательный метод проксимального "раскрытия" (декажинга) для активации белков по требованию и модуляции белок-белковых взаимодействий в живых мышах.
Проблема и решение:
- Предыдущая технология CAGE-Prox позволяла универсально активировать белки с высоким пространственно-временным разрешением, но зависела от УФ-света, который плохо проникает в ткани.
- CAGE-Proxvivo решает эту проблему, используя реакцию биоортогонального расщепления, запускаемую малой молекулой, что применимо в живых организмах.
Как это работает:
- С помощью машинного обучения эволюционировали аминоацил-тРНК-синтетазу для внедрения химически "закрытых" (кэджированных) аминокислот в специально спроектированные сайты декажинга в белке.
- Это временно блокирует функцию целевого белка.
- Функция восстанавливается in situ с помощью биоортогональной реакции, запускаемой малой молекулой.
Возможности и примеры применения:
Универсальная активация белков по требованию в живых системах.
Точный контроль белок-белковых взаимодействий.
Создание "закрытого" анти-CD3 антитела для химически регулируемого рекрутирования и активации Т-клеток в опухолях.
Активация пироптоза (вид клеточной смерти) специфично в опухолевых клетках, что стимулирует мощный противоопухолевый иммунный ответ (потенциал для иммунотерапии).
Значение:
Метод устанавливает универсальную платформу для исследований с временным разрешением и терапевтических вмешательств по требованию in vivo. Работа опубликована в журнале Cell 27 мая 2025 года.