Быстрый тест на инфекции у собак может снизить устойчивость к антибиотикам

Ученые разработали новый способ быстрой диагностики бактериальных инфекций у собак, позволяющий провести тестирование и назначить лечение подходящими антибиотиками в тот же день.

Метод может устранить задержки, связанные с традиционной диагностикой, при которой образец культивируется несколько дней для идентификации бактерий перед назначением лечения.

Это значительный шаг к рациональному использованию антибиотиков, так как он ограничивает применение неподходящих или антибиотиков широкого спектра при неидентифицированных инфекциях и предотвращает длительные курсы лечения.

Разработка также может быть применена в ветеринарной и человеческой медицине для бактериальных и других типов инфекций.

Новый подход

Команда использовала наборы, оптимизированные для распространенных видов бактерий, что позволило извлечь всю ДНК из образца без предварительного знания о присутствующих видах — так называемую метагеномную экстракцию ДНК.

Это сочеталось с существующей технологией нанопорового секвенирования, генерирующей код ДНК из образцов, и инструментом анализа данных, идентифицирующим бактерии по их ДНК-отпечатку.

Быстрые результаты

Такой подход позволяет идентифицировать бактерии в реальном времени, получая результаты за несколько часов.

Идентифицированные в образце гены также дают ценную информацию о вероятной реакции присутствующих бактерий на антибиотикотерапию, позволяя врачам назначать наиболее подходящий препарат.

Команда протестировала систему на кожных и мочевых бактериальных инфекциях у собак и смогла обнаружить бактерии в течение пяти часов.

Они смогли идентифицировать виды бактерий, которые трудно определить с помощью обычного культивирования, и с высокой чувствительностью установить, вероятна ли устойчивость присутствующих бактерий к антибиотикам.

Широкое применение

Система разработана для адаптации к использованию на различных образцах и инфекциях у разных видов животных.

В будущем она может быть полезна для широкого спектра инфекций у животных и людей, потенциально помогая в диагностике и лечении других типов инфекций, вызванных вирусами и паразитами. Исследование опубликовано в Microbial Genomics.

"Наш метод предлагает быстрый способ диагностики бактериальных инфекций и назначения соответствующих антибиотиков в течение нескольких часов после тестирования пациента. После нашей работы с кожными и мочевыми инфекциями у собак мы уверены, что этот подход имеет потенциал для использования у многих видов животных, а также у людей, и имеет применение при других типах инфекций. Он может сыграть значительную роль в обеспечении ответственного использования противомикробных препаратов и ограничении устойчивости к ним", — говорит доктор Натали Ринг.