Названы десятки тысяч безымянных видов бактерий в эпоху больших данных

Исследователи из Великобритании и Австрии присвоили названия более чем 65 000 различным видам микробов. Работа, опубликованная в International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, использует традицию создания произвольных латинских названий, но применяет её в беспрецедентном для таксономии масштабе.

Ведущий автор, профессор Марк Паллен, отмечает, что микробиология стала жертвой собственного успеха: за последние годы открыты десятки тысяч новых видов, но большинство из них остаются безымянными. Существующий подход даёт около тысячи новых названий в год. При таком темпе и с учётом более 50 000 уже классифицированных, но неназванных видов, на их именование уйдёт полвека, а за это время будут открыты миллионы новых.

Команда использовала эффективный подход, основанный на больших данных: компьютерная программа сгенерировала десятки тысяч уникальных, но простых названий, не похожих на существующие слова. Чтобы соответствовать требованию латинизации, произвольные строки букв латинского алфавита были объединены с грамматически правильными женскими суффиксами. Результат — названия, напоминающие латынь по форме, но лишённые смысла. Примеры: Dupisella tifacia (бактерия из кишечника овцы), Hopelia gocarosa (из подземных вод Швеции), Saxicetta apufaria (из российского солёного озера).

Создание произвольных названий имеет давнюю традицию, восходящую к первому кодексу номенклатуры 1869 года и самому Линнею. Новизна — в ошеломляющем масштабе: каталог названий занимает более десяти тысяч страниц, что делает эту публикацию крупнейшим единовременным актом именования видов в истории.

Поскольку названия присвоены видам, обнаруженным с помощью секвенирования ДНК, но ещё не выращенным в лаборатории (in vitro), они пока остаются предварительными. Однако, так как кодекс номенклатуры требует стабильности, а других масштабных подходов к именованию нет, вероятно, подавляющее большинство новых названий будут использоваться в науке долгие годы или даже века.

«Это лишь первый шаг. Эпоха открытия микробов далека от завершения, но теперь будет легко создавать будущие названия массово, используя установленные нами принципы», — заключает профессор Паллен.