Глобальная сеть разработала протоколы для исследования белков SARS-CoV-2
Исследователи из Университета Гёте во Франкфурте и Технического университета Дармштадта с начала пандемии создали международную сеть. Их цель — описывать трёхмерные структуры молекул SARS-CoV-2 с помощью спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР).
Второй ключевой результат работы сети
Координируемая профессором Харальдом Швальбе сеть, объединяющая 129 учёных, достигла второго важного результата. Ранее консорциум сделал доступными все важные фрагменты РНК вируса. Теперь удалось произвести и очистить 23 из почти 30 белков SARS-CoV-2 полностью или в виде релевантных фрагментов в больших количествах.
Как производили белки
- Генетическую информацию о белках внедрили в кольцевые молекулы ДНК (плазмиды).
- Плазмиды ввели в бактерии для производства белков. Некоторые специальные белки производили в бесклеточных системах.
- Правильную пространственную структуру (фолдинг) выделенных белков подтвердили, в частности, с помощью ЯМР-спектроскопии.
Значение работы
- Ускорение поиска лекарств: Лаборатории по всему миру могут начать исследования белков SARS-CoV-2 и их мутантов в течение двух недель, используя готовые протоколы, вместо нескольких месяцев на их разработку.
- Доступность: Консорциум бесплатно предоставляет как рабочие протоколы, так и сами плазмиды.
- Исследование мутаций: Наличие надёжных и быстрых методов особенно важно для изучения будущих мутаций вируса, включая малоисследованные вспомогательные белки, которые также влияют на возникновение мутаций.