Бактериальный белок «собирает» вирусы в загрязнённой воде

Доступ к чистой воде — это необходимость, которую часто принимают как данность. Однако, по оценкам ЮНИСЕФ, 900 миллионов человек в мире не имеют доступа к безопасной питьевой воде. Новое исследование, опубликованное в открытом журнале BMC Biotechnology, показывает, что белок, связывающий энтеровирусы (EVBP), выделенный из бактерий активного ила, способен захватывать вирусы, часто присутствующие в загрязнённой воде.

Одна из сложностей измерения вирусного загрязнения воды заключается в том, что вирусы могут присутствовать в очень низкой концентрации, но всё равно вызывать болезни. Даже один энтеровирус может инфицировать человека и вызвать гастроэнтерит, а эти вирусы могут долго выживать в воде.

Исследователи из Университета Тохоку и Университета Хоккайдо использовали активный ил, образующийся при очистке сточных вод, в качестве исходного материала для поиска белка, способного связываться с энтеровирусами. С помощью ПЦР учёные выделили ген, кодирующий одну из субъединиц белка GroEL, из ДНК ила. GroEL — это «шаперонный» белок из 14 субъединиц, который обеспечивает правильное сворачивание белков при их синтезе.

Биохимические и ферментативные анализы показали, что выделенная субъединица способна захватывать энтеровирусы. GroEL может связываться с гидрофобными аминокислотами на поверхности белков, и считается, что новый изолированный EVBP аналогичным образом связывается с гидрофобными участками на поверхности вирусов и вирусных фрагментов.

Доктор Дайсукэ Сано из Университета Хоккайдо пояснил: «В отличие от вирус-специфичных и дорогих антител, EVBP связывал все протестированные нами энтеровирусы (норовирус, ротавирус и полиовирус). После разработки этот простой в использовании метод может применяться для обнаружения низких концентраций вирусов в клинике или окружающей среде».