Создан хромосомный геном альдабрской гигантской черепахи для сохранения вида

Международная команда исследователей завершила сборку высококачественного хромосомного генома альдабрской гигантской черепахи (Aldabrachelys gigantea). Эта работа, опубликованная в журнале GigaScience, предоставляет важнейший инструмент для сохранения одного из двух оставшихся в мире видов гигантских черепах, имеющего статус «уязвимый» по классификации Международного союза охраны природы (МСОП).

Генетический ключ к сохранению

Альдабрская черепаха, обитающая на атолле Альдабра к северо-западу от Мадагаскара, может весить до 300 кг и жить более 100 лет. По некоторым данным, возраст отдельных особей достигает 250 лет. Ведущий исследователь Гёзде Чилингир (Университет Цюриха) подчеркивает: «Геномная информация важна для программ разведения в зоопарках, чтобы поддерживать генетическое разнообразие, присутствующее в дикой природе».

Новый геном, собранный на уровне хромосом, представляет собой почти полную и правильно упорядоченную последовательность из более двух миллиардов генетических «букв». Это позволяет с высокой точностью отслеживать генетические вариации в популяциях.

Практическое применение

Чтобы продемонстрировать практическую пользу, ученые секвенировали геномы 30 черепах из дикой популяции и двух особей из Цюрихского зоопарка. Сравнив эти данные с эталонным геномом, они смогли определить, из какой части атолла Альдабра происходят черепахи, живущие в зоопарке.

Исследование также показало, что геном альдабрской черепахи в целом схож с другими известными геномами отряда Testudines (черепахи). «Наши данные будут чрезвычайно полезны не только для альдабрской черепахи, но и для всех восточноафриканских и мадагаскарских черепах», — отмечает Чилингир.

Роль в экосистеме

Гигантские черепахи, потребляя огромное количество растительности, играют ключевую роль в формировании островных ландшафтов, выступая в роли «инженеров экосистем». Их реинтродукция в естественную среду может помочь восстановить деградировавшие островные habitats и послужить экологической заменой вымершим видам гигантских черепах на островах Западной Индии.

Наличие высококачественного эталонного генома открывает возможности для ответа на фундаментальные биологические вопросы, например, о генетических причинах гигантских размеров и долголетия этих животных, что является важным шагом к их долгосрочному сохранению.