Вирус желтой лихорадки, ответственный за текущую эпидемию в Бразилии, возник в Амазонии в 1980 году

Ученые из Института Адольфо Лутца (IAL) и Университета Сан-Паулу (USP) установили происхождение штамма вируса, вызвавшего самую масштабную за 40 лет эпидемию желтой лихорадки в Бразилии.

Молекулярное исследование вирусов, выделенных из тканей мертвых обезьян и комаров, показало, что штамм, ответственный за текущую эпидемию, возник в штате Пара на севере Бразилии в 1980 году.

Вирус инфицировал обезьян в Пара и распространился по всему региону Амазонии, достигнув Венесуэлы и Суринама. С 2000 года, также через заражение обезьян, болезнь мигрировала в центрально-западные и юго-восточные регионы Бразилии, достигнув штата Сан-Паулу в 2013 году. Первые случаи гибели людей в Сан-Паулу зафиксированы в 2016 году.

Исследование поддержано Фондом исследований Сан-Паулу (FAPESP), его результаты опубликованы в Scientific Reports.

Масштабы эпидемии и ее влияние на приматов

С середины 2016 года, когда началась текущая эпидемия, подтверждено 2245 случаев заболевания у людей, из них 764 — с летальным исходом (данные Минздрава).

Другая сторона проблемы — массовая гибель обезьян от того же вируса, который передают комары. С 2016 года в эпидемиологическом надзоре собрано более 10 000 туш обезьян, в основном ревунов (Alouatta spp.), игрунок (Callithrix spp.) и капуцинов (Sapajus spp.). Вирус желтой лихорадки обнаружен в 3403 случаях.

Более 90% погибших обезьян, по оценкам, относятся к виду Alouatta guariba, чрезвычайно восприимчивому к вирусу. Отмечались случаи полной гибели стай из более чем 80 особей.

Циклы передачи и распространение вируса

  • Сильватический (лесной) цикл: вирус циркулирует между комарами родов Haemagogus и Sabethes и обезьянами. Люди — случайные хозяева, заражающиеся при нахождении в лесу.
  • Городской цикл: вирус передается между людьми комаром Aedes aegypti (в Бразилии искоренен благодаря вакцинации).

В последние два десятилетия передача вируса людям происходила за пределами эндемичного региона Амазонии. С конца 2016 года болезнь распространилась быстрее и дальше, достигнув биома Атлантического леса, где не регистрировалась десятилетиями.

Исследование образцов

Ученые исследовали 430 образцов тканей мозга, печени и селезенки от мертвых обезьян, собранных с июля 2016 по март 2017 года. Вирус желтой лихорадки обнаружен в 67 образцах:

  • 30 — от ревунов (Alouatta)
  • 9 — от игрунок (Callithrix)
  • 7 — от капуцинов (Sapajus)
  • 21 — от обезьян неустановленного рода (предположительно Alouatta из-за высокой вирусной нагрузки)

Исследование подтвердило, что болезнь протекает тяжелее у ревунов и игрунок, в то время как капуцины более устойчивы.

Эволюционный путь вируса

Секвенирование геномов 67 выделенных вирусов и их сравнение с данными по вспышкам 1980–2015 годов позволило восстановить путь распространения:

  • 1980: вирус эндемичен в штате Пара.
  • 2000: достигает штатов Мату-Гросу-ду-Сул, Гояс и Минас-Жерайс.
  • 2004: проникает в Венесуэлу.
  • 2009: достигает Тринидада и Тобаго в Карибском бассейне.
  • 2010: присутствует в штате Рорайма (север) и Риу-Гранди-ду-Сул (юг).
  • 2013: вирус прибывает в штат Сан-Паулу.
  • К 2017 году: вирус широко распространен в большинстве штатов Бразилии и в Суринаме.

Текущие исследования сосредоточены на образцах, собранных во вторую (июль 2017 – июнь 2018) и третью (с июля 2018) волны эпидемии. Их результаты помогут определить, идет ли эпидемия в Сан-Паулу на спад или вирус продолжает циркулировать среди популяций обезьян, создавая угрозу новых вспышек.

2019-07-02