Метод ускоряет анализ сложных микроскопических изображений

Криоэлектронная томография позволяет исследователям детально изучать микроскопические структуры внутри клеток. Благодаря новому автоматизированному методу, разработанному учёными из Медицинского колледжа Бейлора и Национального университета Сингапура, анализ трёхмерной структуры одной клетки, который обычно занимал неделю, теперь можно выполнить примерно за час. Это позволит изучать большее количество и разнообразие типов клеток за меньшее время, что приведёт к более детальному пониманию клеточных процессов и заболеваний. Отчёт опубликован в журнале Nature Methods.

«Криоэлектронная томография — это мощная технология для визуализации архитектуры и структур внутри клеток с разрешением примерно в 100 раз лучше, чем у лучшего светового микроскопа», — заявил автор-корреспондент доктор Стивен Лудтке.

Этот метод предоставляет информацию о клеточных процессах, недоступную другими современными методами. Однако «необходимость примерно одной человеко-недели усилий для ручной аннотации всех структур и деталей внутри каждой клетки ограничивала широкое использование этой техники», — отметил Лудтке.

Чтобы повысить эффективность этого трудоёмкого процесса, Лудтке и его коллеги разработали автоматизированный метод, требующий меньшего участия человека. Они протестировали его на разных типах клеток, включая человеческие тромбоциты и микроорганизмы, такие как африканские трипаносомы и цианобактерии. Сравнение нового метода с традиционным показало, что новая методология правильно идентифицирует внутриклеточные структуры с высоким уровнем точности.

«Новый метод сокращает человеческие усилия примерно с одной недели на клетку до примерно одного часа на клетку», — сказал Лудтке.

Метод доступен бесплатно по адресу http://EMAN2.org вместе с интерфейсом для обучения.