Новый тест улучшает диагностику мыта у лошадей

Исследование, начатое в Лаборатории инфекционных болезней лошадей (EIDL) Техасского университета A&M для изучения геномных компонентов мыта, привело к разработке улучшенного теста в Ветеринарно-медицинской диагностической лаборатории Техаса (TVMDL).

Мыт — высококонтагиозное заболевание, поражающее верхние дыхательные пути и лимфатические узлы лошадей. Его вызывает бактерия Streptococcus equi subspecies equi (S. equi). Хотя клинические признаки могут присутствовать, только диагностическое обнаружение является окончательным методом идентификации мыта.

Предок S. equi, Streptococcus equi subspecies zooepidemicus (S. zoo), считается комменсальным организмом и может вызывать пневмонию, эндометриоз и аборты у лошадей. Вместе оба организма способствуют высокой заболеваемости и вариабельной смертности среди лошадей.

Текущие методы обнаружения

Традиционно мыт выявляли культивированием S. equi и S. zoo — медленным и не очень чувствительным методом. Со временем были разработаны тесты с использованием технологии полимеразной цепной реакции (ПЦР) для индивидуального обнаружения S. equi и S. zoo.

Хотя ПЦР-тестирование быстрее и чувствительнее бактериального посева, оно всё ещё имеет ограничения. ПЦР использует праймеры для нацеливания на специфические последовательности ДНК. Из-за генетического сходства между S. equi и S. zoo некоторые тесты не могут их различить, что может приводить к ложноположительным результатам.

И наоборот, в некоторых образцах обычно целевая последовательность S. equi оказывается укороченной или удалённой, что приводит к ложноотрицательному результату. Другие ПЦР-тесты, например, ранее использовавшийся в TVMDL, не могут дифференцировать коинфекцию S. equi и S. zoo из-за множественных генетических сходств организмов.

Улучшенное ПЦР-тестирование

Новые праймеры были разработаны на основе штаммов S. equi и S. zoo, собранных из клинических образцов техасских лошадей, а также с использованием общедоступных штаммов со всего мира. Молекулярно-диагностическая секция TVMDL провела валидационное тестирование с новыми праймерами и установила, что они могут использоваться для обнаружения и дифференциации между S. equi и S. zoo. Этот тест также включает внутренний контроль для мониторинга эффективности ПЦР и ингибирования образца.

После валидации TVMDL теперь может использовать эти праймеры для рутинной диагностики.