Синтетический метаболический путь фиксирует CO₂ эффективнее растений

Исследователи из Института наземной микробиологии им. Макса Планка создали синтетический метаболический путь, который преобразует атмосферный CO₂ в органическое вещество эффективнее естественного фотосинтеза растений.

Цель и потенциал для климата

Основная цель работы — понять фундаментальные принципы преобразования газообразного CO₂ в органические молекулы, а не прямое решение проблемы изменения климата. Однако разработка таких процессов, потенциально CO₂-нейтральных или даже удаляющих CO₂ из атмосферы, станет важным побочным эффектом. Дизайнерские метаболические пути, требующие меньше энергии на молекулу CO₂ или фиксирующие его быстрее, — перспективный подход для CO₂-биотехнологий.

Текущий статус: фундаментальные исследования

Пока работа остаётся чисто фундаментальной. Учёным впервые удалось воссоздать в пробирке базовый процесс жизни — превращение CO₂ в органику, создав своего рода «метаболический орган in vitro». Однако трансплантация этого 17-стадийного цикла в живые клетки, где одновременно протекают около 3000 реакций, — отдельная сложнейшая задача, решение которой может занять много времени.

Ключевые трудности при создании пути

  1. Поиск компонентов: После быстрой теоретической проработки цикла на бумаге потребовалось более двух лет на его экспериментальную реализацию. Из более чем 50 миллионов известных генов и 40 000 ферментов нужно было отобрать, протестировать и совместить нужные биологические компоненты.
  2. Несовместимость ферментов: Один из ферментов изначально работал только с агентом на основе железа (Fe), который вызывал коагуляцию других ферментов. Проблему решили, модифицировав фермент для работы с совместимым кислородным агентом.
  3. Низкая эффективность и ошибки: Цикл сначала работал медленно и быстро останавливался из-за большого количества реакционных ошибок. Нестандартным решением стало добавление в цикл дополнительных ферментов-«корректоров», устраняющих эти ошибки. Такие метаболические петли коррекции, вероятно, важны и в естественном метаболизме.

Особенности и вызовы синтетической биологии

  • Новый подход: Биологи привыкли разбирать системы на части, а не создавать новые с нуля. Для синтетической биологии ещё предстоит установить правила проектирования сложных систем, например, понять, какие ферменты совместимы и когда биохимические реакции нужно разделять (как в природных органеллах).
  • Не об «искусственной жизни»: Речь не о «создании жизни» или «роли Бога». Более реалистичная ближайшая цель — перепрограммирование отдельных живых процессов, например, создание саморемонтирующегося и самоподдерживающегося биологического производственного цикла.
  • Сложность биосистем: Биологические системы высокосложны и взаимосвязаны. Фермент — не просто катализатор, он регулируется своими продуктами (ингибируется при их избытке), что тесно связывает функцию и передачу информации.
  • Роль несовершенства и эволюции: В отличие от технических систем, биологические способны адаптироваться и развиваться. Ошибки ферментов (побочные реакции) — это возможность для появления новых функций, подобно нахождению нового пути после неверного поворота. Для синтетической биологии ключевая задача — понять, как интегрировать несовершенство, эволюцию и сложность в конструируемые системы.

Будущее и потенциал

Истинный потенциал синтетической биологии ещё трудно оценить. Её развитие может повторить путь химии, которая в XIX веке превратилась из аналитической в синтетическую дисциплину, открыв путь к новым материалам и лекарствам. Для подобного прорыва в биологии требуется время и глубокое понимание фундаментальных принципов конструирования сложных биологических систем.

2016-11-25