Предсказуемость — главная цель синтетической биологии
Исследователи консорциума BIOFAB первыми достигли значительного прогресса в повышении предсказуемости генной инженерии. Они представили набор последовательностей ДНК и статистических моделей в открытом доступе, которые значительно повышают надежность и точность конструирования биологических систем.
Достижение: BIOFAB создал независимые последовательности ДНК — промоторы и сайты связывания рибосом — для точного контроля экспрессии генов в бактерии Escherichia coli.
Значение: Эти стандартизированные «детали» для E. coli также устанавливают правила их совместной работы, которые должны быть применимы и к другим микроорганизмам.
Проблема: Даже в хорошо изученной E. coli введение новых генов раньше было столь же непредсказуемым, сколь и успешным.
Два ключевых результата:
- Дизайн специфичных последовательностей ДНК для E. coli.
- Разработка математических моделей, предоставляющих правила инженерии экспрессии генов, применимые практически ко всем организмам.
Цель: Сделать проектирование биологических систем таким же предсказуемым, как сборка компьютерного оборудования.
Публикация: Результаты описаны в двух статьях в журнале Nature Methods и третьей — в Nucleic Acids Research.
BIOFAB («первое в мире предприятие по биологическому проектированию и сборке») был основан в декабре 2009 года при гранте Национального научного фонда США и работает под руководством Калифорнийского университета в Беркли и Стэнфордского университета.