Ученые подтвердили существование шести уникальных штаммов вируса африканской чумы свиней

Исследователи из Службы сельскохозяйственных исследований Министерства сельского хозяйства США (USDA-ARS) пересмотрели классификацию штаммов вируса африканской чумы свиней (АЧС), сократив их число с 25 до шести уникальных генотипов. Это открытие может изменить подход к классификации изолятов вируса АЧС (ASFV) и упростить разработку вакцин, соответствующих циркулирующим в эндемичных регионах штаммам.

Исследование опубликовано в журнале Viruses.

«Ранее по всему миру было идентифицировано 25 различных генотипов вируса, — сказал старший научный сотрудник ARS Дуглас Глэдью. — Наша команда недавно повторно оценила все общедоступные последовательности ДНК вируса и обнаружила, что большинство генотипов, изначально идентифицированных как новые, были определены неверно и не сравнены с уже существующими генотипами ASFV. Согласно этому анализу, уникальных генотипов на самом деле меньше, чем считало научное сообщество, изучающее АЧС. Это означает, что разнообразие ASFV, поражающего популяции по всему миру, меньше. Эта информация важна, поскольку может сократить количество вакцин, которые, как ранее считалось, необходимы для защиты от всех генотипов ASFV».

Точная классификация вирусов крайне важна для эпидемиологических исследований и разработки экономически эффективных мер противодействия, включая создание вакцин против уникальных штаммов ASFV.

Масштабная работа включала повторный анализ исследователями ARS более 12 000 исторических и современных изолятов вируса, полученных из лабораторий по изучению АЧС по всему миру. Анализ стал возможен благодаря вычислительной мощности суперкомпьютерного кластера SciNet, который ARS использует для решения задач, связанных с большими данными в сельском хозяйстве.

Несмотря на то, что вирус ASFV наносит значительные экономические потери мировой свиноводческой отрасли, вспышек заболевания в США не было. Высококонтагиозный вирус АЧС распространился из Африки в Грузию в 2007 году, а затем прошел через Европу, Доминиканскую Республику и Азию, достигнув Южной Африки в начале 2023 года. Вирус не может передаваться от свиней к человеку.

В исследовании также участвовали Национальный центр биологической и агрозащиты (NBAF), Канадское агентство по инспекции пищевых продуктов и Университет Макерере в Уганде.