Ученые разработали технику анализа структур РНК в сверхвысоком разрешении
Ученые из Ноттингемского университета разработали метод анализа атомарной структуры молекул РНК с исключительной точностью и скоростью. Они стали первыми в мире, кто использовал этот метод для изучения структурных изменений РНК при заражении клетки ВИЧ.
Результаты, опубликованные в Nature Communications, могут иметь далеко идущие последствия для лечения различных заболеваний, в которых РНК играет ключевую роль, и для разработки терапевтических средств, таких как мРНК-вакцины.
РНК, близкий родственник ДНК, играет критическую роль в различных биологических процессах — от синтеза белка до регуляции генов. Однако, в отличие от известной двойной спирали ДНК, РНК сворачивается в сложные формы, которые чрезвычайно трудно анализировать традиционными методами.
Команда из Ноттингема под руководством доктора Адити Боркар, доцента молекулярной биохимии и биофизики, достигла прорыва.
Доктор Боркар разработала мощный метод, сочетающий передовую технологию масс-спектрометрии криогенный OrbiSIMS — уникальную возможность визуализации университета — с продвинутым компьютерным моделированием и автоматизацией. Это позволило команде анализировать аттомольные количества РНК и определять их 3D-структуры в соответствии с отраслевыми стандартами в течение нескольких дней.
Этот инновационный подход обещает значительный прогресс в масштабе, точности и скорости структурной биологии РНК и ускорит разработку РНК-терапевтиков.
Доктор Боркар заявила: «РНК — одни из самых сложных для изучения структурной биологией молекул. OrbiSIMS как минимум в 1000 раз чувствительнее для изучения РНК по сравнению с другими структурными методами, обычно используемыми в нашей области.
С помощью нашего конвейера, управляемого OrbiSIMS, мы теперь можем определять структуры РНК за несколько дней вместо месяцев. Эта невероятная чувствительность и скорость теперь помогут нам изучать ранее недоступные мишени в сжатые сроки разработки лекарств».
Инструмент OrbiSIMS был разработан в Национальной физической лаборатории Великобритании при консультации с GSK. Ноттингемский университет стал первым в мире, кто приобрел и начал использовать инструмент OrbiSIMS.