Ученые разработали метод скрининга для исследований РНК-препаратов

Ученые из кампуса Флориды Исследовательского института Скриппса (TSRI) создали новый метод скрининга более трех миллионов комбинаций взаимодействий между РНК и малыми молекулами. Цель — выявить лучшие мишени на РНК и наиболее перспективные потенциальные лекарственные соединения. Эта технология может повысить эффективность разработки лекарств.

Исследование опубликовано 9 октября 2012 года в журнале Nature Communications.

РНК выполняет множество биологических функций, включая кодирование и трансляцию белков с генов, а также регуляцию уровня экспрессии белка в различных клеточных условиях. Недавние исследования определили РНК как "молекулярный переключатель", контролирующий клеточные события, такие как экспрессия генов, что делает РНК привлекательной мишенью для малых молекул.

Однако до сих пор информации о том, какие малые молекулы связываются с какими участками (структурными мотивами) РНК, было мало, что тормозило это перспективное направление исследований.

"Впервые мы смогли исследовать, какие типы малых молекул могут быть хорошими лид-препаратами для нацеливания на РНК, проанализировав миллионы комбинаций РНК-лиганд", — сказал Мэтью Дисней, доцент TSRI, автор исследования вместе с аспирантом Туаном Траном.

В исследовании удалось определить те РНК-мотивы (включая шпилечные петли), которые связываются с малыми молекулами, и типы малых молекул, связывающихся с РНК.

Новый метод можно использовать для создания легко доступных библиотек малых молекул, смещенных в сторону связывания с РНК. Технология также будет применяться в компьютерной программе, разработанной Диснеем, которая объединяет данные о взаимодействии малых молекул и РНК с информацией о складках РНК в сегментах генома человека, способствующих развитию конкретных заболеваний.