Новые молекулы РНК могут играть роль в старении
Исследователи из Университета Томаса Джефферсона, используя разработанные ими новые инструменты, обнаружили множество молекул РНК нового подтипа в клетке и получили свидетельства их возможной роли в процессах старения.
Изучение "неизвестных" коротких РНК
Большинство исследований было сосредоточено на микроРНК, которая может "заглушать" матричную РНК. Команда под руководством Ёхэя Кирино решила изучить другие, более трудные для обнаружения короткие РНК.
Что такое цП-РНК?
Изучаемый подтип — это РНК, содержащая циклический фосфат (cP-RNA). Ранее считалось, что эта необычная форма фосфата — лишь промежуточный продукт при расщеплении РНК. Стандартные методы секвенирования не могут уловить РНК с таким "хвостом".
Новый метод и неожиданные открытия
Три года назад лаборатория Кирино разработала систему для амплификации и секвенирования цП-РНК. Полное секвенирование тканей мыши выявило:
- Большое количество: цП-РНК оказалось гораздо больше, чем ожидалось.
- Разнообразие: новые виды цП-РНК образуются из различных типов клеточных РНК (транспортных, матричных, рибосомных).
- Высокая концентрация: например, одна цП-РНК из рибосомной РНК была в 300 раз более распространена, чем все разновидности микроРНК в клетке вместе взятые.
- Распространённость: цП-РНК присутствовали во всех исследованных тканях мыши (лёгкие, мышцы, селезёнка, тимус).
- Связь со старением: количество цП-РНК менялось со временем, уменьшаясь по мере старения мыши.
Выводы и перспективы
Открытие указывает, что циклические фосфаты могут быть вовлечены в функции различных РНК. Учитывая их обилие, повсеместное распространение в тканях и изменение количества с возрастом, эта область требует дальнейшего изучения. Лаборатория Кирино уже исследует роль цП-РНК при астме, инфекционных заболеваниях и раке.
Исследование опубликовано в PLOS Genetics 13 января.