Влияние положения гена на его активность: проверка гипотезы "гистонового кода"

Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего использовали технологию нокаута генов для проверки влияния положения гена в хроматине на его активность. Они проанализировали один и тот же репортерный ген, вставленный в 90 различных позиций хромосомы 1 дрожжей.

Ключевые результаты

• Вставленный ген не изменял окружающий его хроматиновый ландшафт.
• Различия в этом локальном хроматиновом окружении измеримо влияли на активность гена.
• Регуляция хроматина (комплекса ДНК и белков в ядре клетки) не подчиняется универсальному "гистоновому коду".
• На экспрессию гена влияют специфические взаимодействия между хроматином и генетическими факторами.

Значение исследования

Как отметил старший автор Трей Айдекер, работа показывает, что эпигенетический эффект зависит как от конкретного набора гистонов и другого эпигенетического материала, так и от идентичности самого экспрессируемого гена. Исследование предоставляет новый инструмент для изучения функционирования генов в зависимости от их положения в хромосоме.

Источник: Cell Reports, опубликовано онлайн 3 января.