Обнаружение нетрадиционных пептидов в винограде с помощью пептидогеномики

Хотя биологические функции большинства нетрадиционных пептидов (NCPs) ещё предстоит изучить, учёные из Хэнаньского университета науки и технологий провели их масштабную идентификацию у Vitis vinifera L.

Результаты исследования

• Из белковых баз данных Arabidopsis thaliana и Vitis vinifera (Ensembl/URGI) и индивидуальной пептидогеномной базы данных было идентифицировано 188 и 2021 уникальных пептида соответственно.
• NCPs широко распространены в геноме винограда, а характер их распределения по хромосомам отличается от распределения традиционных пептидов (CPs).

Функциональный анализ

Для анализа функций NCPs учёные сопоставили их локализацию с положением:

• Количественных признаковых локусов (QTLs): около 94% NCPs расположены в QTLs, связанных с развитием, внутренним качеством, устойчивостью к болезням и качеством плодов.
• Ретротранспозонов LTR.
• Регионов доместикационного отбора.

Также исследовалась специфичность экспрессии NCPs на разных стадиях развития.

Значение работы

Это первое масштабное исследование NCPs в винограде. Как отметил профессор Го, оно показало, что в геноме происходит обширная трансляция. Результаты закладывают основу для изучения функций NCPs и служат ориентиром для поиска новых функциональных генов винограда.

Исследование опубликовано в журнале Horticulture Research.