Оптическая скрининговая платформа: объединение генетики и микроскопии для изучения клеток

Учёные разработали новый метод оптических пуловых скринингов (optical pooled screens), который объединяет масштабные генетические пуловые скрининги с микроскопическим анализом поведения клеток.

Проблема традиционных методов

• Генетические скрининги (особенно пуловые) позволяют изучать влияние тысяч генов, но дают ограниченные данные (например, только о выживаемости клеток).
• Микроскопия даёт детальную пространственно-временную информацию о клетках, но её комбинация с генетикой была дорогой и медленной при работе с одним геном за раз.

Суть нового подхода

Метод позволяет с помощью микроскопии за несколько дней скринировать тысячи генов и изучать их влияние на сложные клеточные процессы с высоким разрешением.

Доказательство концепции

В исследовании (Cell) учёные изучили влияние 952 генов на сигнальную активность иммунорегулирующего комплекса NF-kB. Они визуализировали локализацию белка p65 в миллионах клеток и обнаружили новую роль генов MED12 и MED24 в ослаблении сигналинга NF-kB.

Ключевое преимущество: Метод позволяет увидеть, как гены влияют на биологические процессы в пространстве и времени, что недоступно другими способами.