Новый метод обнаружения РНК при комнатной температуре устраняет необходимость в сложном лабораторном оборудовании
Исследователи из UConn Health разработали новый метод обнаружения рибонуклеиновой кислоты (РНК), не требующий сложных лабораторных процедур или нагревательного оборудования.
Опубликованный в Nature Communications, метод под названием CAARRD (CRISPR Anti-tag Mediated Room-Temperature RNA Detection) был создан профессором Чанчуном Лю. Он открывает путь к более простому обнаружению вирусных РНК, таких как ВИЧ.
Стандартные тесты CRISPR/Cas13a — мощный инструмент для обнаружения РНК. Однако для простого и высокочувствительного обнаружения с помощью Cas13a требуются предварительная амплификация (увеличение числа мишеней) и повышенные температуры.
«С помощью CARRD мы смогли обнаружить чрезвычайно малые количества РНК ВИЧ и HCV — вплоть до 10 аттомоляр, что в 10 000 раз чувствительнее стандартных тестов CRISPR/Cas13a», — говорит Лю.
В исследовании были найдены специальные «анти-тэговые» последовательности CRISPR, которые могут блокировать активность фермента Cas13a. Это открытие привело к созданию теста CAARD, упрощающего процесс обнаружения.
Поскольку CAARD работает при комнатной температуре, тест эффективно снижает сложность и время, связанные с несколькими этапами обработки.
Это открывает путь к более простому, чувствительному, быстрому и экономичному обнаружению вирусных РНК, что может расширить доступность таких тестов в различных клинических и экологических условиях.
«Мы успешно протестировали метод на реальных образцах пациентов, обнаружив РНК ВИЧ в клинической плазме. Это показывает потенциал подхода для недорогого и точного тестирования на вирусы в условиях ограниченных ресурсов», — отмечает Лю.
Будущие проекты будут сосредоточены на адаптации теста CARRD к альтернативным форматам считывания, таким как бумажные тест-полоски или интеграция с портативными недорогими флуоресцентными считывателями, чтобы повысить его пригодность для применения у постели больного в условиях низкой ресурсообеспеченности.