Ученые создали почти хромосомный геном для пчелы Mojave poppy bee

Исследователи из Службы сельскохозяйственных исследований (ARS) Министерства сельского хозяйства США (USDA) и университетов-партнеров разработали почти хромосомный геном для пчелы Mojave poppy bee — специализированного опылителя, вызывающего опасения с точки зрения сохранения вида. Работа опубликована в Journal of Heredity.

Сборка генома Mojave poppy bee является частью проекта Beenome100 — первой в своем роде инициативы по созданию библиотеки высококачественных и детальных геномных карт для 100 или более разнообразных видов пчел, обитающих в США.

Mojave poppy bee (Perdita meconis) — одиночная, роющая пчела из семейства Andrenidae, обитающая исключительно в восточной части пустыни Мохаве. Она специализируется на опылении мака Las Vegas bearpoppy (Arctomecon californica) и карликового мака (Arctomecon humilis), последний из которых находится под защитой Закона США об исчезающих видах с 1979 года. Эти маки растут в основном на гипсовых почвах, которые редко встречаются в регионе.

Сама пчела Mojave poppy bee и мак Las Vegas bearpoppy также рассматриваются для включения в список Закона об исчезающих видах. Их популяции могут сокращаться из-за изменения климата и потери среды обитания в результате урбанизации и добычи полезных ископаемых.

Значение генома:

• Поможет понять биологические особенности пчелы.
• Позволит изучить генетическую основу специализации на растениях-хозяевах, восприимчивости к пестицидам, засухе и изменению климата.
• Ключевая адаптация: пчела способна переживать засушливые годы, оставаясь в земле в состоянии покоя — диапаузы. Геном может раскрыть гены и регуляторные пути, стоящие за этой адаптацией.
• Позволит оценить генетическое здоровье вида и найти генетические признаки его сокращения.

Как создавали геном:

ДНК для секвенирования была выделена из одного крошечного самца пчелы (длиной 5–7 мм), собранного в полевых условиях в удаленной wilderness-зоне. Успех проекта, несмотря на неидеальные методы сохранения образца, стал возможен благодаря технологическому прогрессу в секвенировании.

Детальная карта референсного генома доступна в базе данных Национального центра биотехнологической информации (NCBI).