Предложена новая структура для публикации данных о биоразнообразии

В рецензируемом журнале опубликована комплексная структура, призванная стимулировать и облегчить обмен данными о биоразнообразии.

24 рекомендации Целевой группы GBIF по структуре публикации данных включены в специальное приложение журнала BMC Bioinformatics.

Некоторые из предложенных мер уже приняты GBIF и другими организациями, включая публикацию «дата-статей» (data papers) для академического признания авторов, публикующих метаданные, описывающие наборы данных.

Другие находятся в разработке, например, новые сервисы для отслеживания и публикации использования данных в Индексе использования данных (Data Usage Index), а также механизм для обеспечения того, чтобы все участники сбора, обработки и публикации данных были указаны в единой цитате.

Представляя структуру публикации данных в центральной статье приложения, Том Мориц и соавторы пишут, что первая рекомендация является основной, из которой следуют все остальные: «Все данные, имеющие отношение к пониманию биоразнообразия и его сохранению, должны быть сделаны свободно, открыто и эффективно доступными».

Авторы определяют структуру публикации данных как среду, способствующую обеспечению свободного и открытого доступа к первичным мировым данным о биоразнообразии: «Основная цель структуры — преодолеть барьеры или препятствия, влияющие на доступ к данным и их публикацию».

В статье далее утверждается, что обмен данными о биоразнообразии должен стать ожидаемой нормой, а данные следует удерживать только в исключительных обстоятельствах, когда необходимо защитить точные локации, например, в случаях, связанных с рыночными растениями или животными, или для видов, вызывающих особую озабоченность. «Мы подчеркиваем, что такие данные представляют собой лишь малую долю данных о биоразнообразии и не должны диктовать обычную практику», — добавляют авторы.

Другие рекомендации включают:

• Расширение и улучшение структуры метаданных, используемой GBIF, чтобы помочь пользователям определить, пригодны ли записи данных для использования.
• Укрепление сети зеркальных сайтов GBIF и «доверенных цифровых репозиториев» или центров хостинга данных.
• Удовлетворение потребности в стабильных и проверенных постоянных идентификаторах (persistent identifiers), чтобы записи данных оставались постоянно обнаруживаемыми и доступными.
• Создание «индекса потенциала биоинформатики» (biodiversity informatics potential index) для демонстрации потенциала и срочности инвестиций стран в управление данными о биоразнообразии (GBIF вскоре выпустит такой индекс).
• Поощрение спонсоров исследований биоразнообразия к установлению обязательных требований о свободном и открытом доступе к данным о биоразнообразии — в статье приветствуются шаги в этом направлении Национального научного фонда США.
• Поощрение профессиональных сообществ и дисциплин к требованию доказательств эффективного обмена данными при оценке для найма, повышения в должности и получения постоянной позиции (tenure).

Авторы статьи заключают: «Реализация этих рекомендаций должна ускорить прогресс в архивировании, курировании, обнаружении и публикации первичных данных о биоразнообразии, поскольку ученые и создатели данных осознают ценность и стимулы для таких усилий. Мы считаем, что реализация наших рекомендаций сетью GBIF и их принятие такими инициативами, как GEO-BON (Глобальная система наблюдений Земли — Сеть наблюдений за биоразнообразием), IPBES (Межправительственная научно-политическая платформа по биоразнообразию и экосистемным услугам) и CBD (Конвенция о биологическом разнообразии), внесут вклад в столь необходимую глобальную исследовательскую инфраструктуру и, в частности, в режим открытого доступа в науке о биоразнообразии и его сохранении».

Отдельные статьи в приложении BMC Biodiversity Informatics посвящены: механизму «дата-статей»; индикаторам для Индекса использования данных; индексу потенциала биоинформатики стран; и предложениям по инфраструктуре хостинга данных.