Исследование взаимодействий между видами на молекулярном уровне

Впервые исследователи из Университета штата Северная Каролина (NC State) применили новый подход для изучения того, как представители двух разных видов — например, растение и патоген или бактерия и человек — взаимодействуют на молекулярном уровне, и могут ли небольшие генетические изменения в одном виде влиять на экспрессию генов в другом.

В статье, опубликованной в журнале Genetics, использован метод генетического картирования — картирование локусов количественных признаков экспрессии (expression quantitative trait locus, или eQTL) — применённый новым способом для описания этих взаимодействий. Это открывает возможности для дальнейшего изучения сложных межвидовых отношений.

Суть метода:

• Исследователи скрестили два генетически различных штамма одного вида — галловых нематод (Meloidogyne hapla) из Калифорнии и Франции. Это дало 98 линий потомства.
• Затем этими нематодами заразили генетически идентичные растения бобовых (Medicago truncatula).
• Различия в экспрессии генов у растений можно было однозначно связать с генетическими различиями у нематод, так как геном растений был одинаковым.

Результаты и значение:

• Метод позволил выявить, какие конкретные гены или локусы в геноме нематоды контролируют наблюдаемые эффекты в растении.
• Исследование выявило ряд ранее неизвестных генов растения, реагирующих на инфекцию.
• Работа закладывает основу для понимания генетической причинности в межвидовых взаимодействиях, а не просто корреляции.

Как отметил соавтор Дэвид МакК. Бёрд, это «совершенно новый способ изучения межвидовых взаимодействий».