Молекулярные штрихкоды: идентификация 16 новых видов Caenorhabditis

Нематоды рода Caenorhabditis обычно считаются почвенными червями. Знаменитый Caenorhabditis elegans дал огромный объем информации о процессах развития и клеточной смерти, стал героем трех Нобелевских премий и даже побывал в космосе. Однако все другие известные виды Caenorhabditis отстоят от C. elegans так же далеко, как мышь от человека.

Новое исследование, опубликованное в журнале BMC Evolutionary Biology, изучило взаимоотношения между десятью известными видами Caenorhabditis и обнаружило еще 16. В процессе выяснилось, что эти нематоды предпочитают жить в гниющих фруктах и растительных остатках, а не в почве.

Команда исследователей из Нью-Йоркского университета и Института Жака Моно в Париже изучила образцы гниющей растительности со всего мира. Черви Caenorhabditis были найдены в образцах из умеренных и тропических зон на четырех континентах, но только в тех, что содержали гниющие фрукты или растительный материал. Некоторые виды, как C. elegans, были найдены во многих местах, другие — только в одном.

Черви были разделены по физическим характеристикам (цвет, длина хвоста, положение репродуктивных органов). Окончательное разделение на виды определялось неспособностью к скрещиванию или получению жизнеспособного потомства. Виды были "молекулярно заштрихкодированы" с использованием ITS2-регионов ДНК.

Ключевые выводы:

• Эволюционное древо всех 26 видов показало множество эволюционных реверсий и конвергенций.
• Например, длина спикул (мужских репродуктивных органов) увеличилась после дивергенции первых видов от предка Caenorhabditis, но снова уменьшилась у более современного предка пяти нынешних видов.
• Гермафродитизм независимо эволюционировал три раза в пределах рода Caenorhabditis.

Новые виды станут важным ресурсом для будущих исследований эволюции геномов, репродуктивных стратегий и развития. Хотя близкий родственник C. elegans все еще не найден, теперь ученые знают, где его искать.