Ученые предлагают создать стандарты метаданных для исследований микробиомов

Доступность данных о микробиомах переживает взрывной рост, особенно в сельскохозяйственных системах. Однако отсутствие единообразия в записи данных затрудняет их совместное использование в разных исследовательских проектах.

Что такое метаданные и зачем они нужны?

Метаданные — это «данные о данных»: информация о том, что, где, когда и как было собрано. Для микробиомного исследования это может включать:

  • Тип культуры
  • Место и время отбора проб
  • Факторы управления посевами
  • Метод экстракции ДНК

Единые стандарты метаданных позволят исследователям интегрировать данные из разных работ, повысят строгость исследований и долгосрочную ценность накопленной информации.

Путь к стандарту

Группа ученых в рамках сети Agricultural Microbiomes Research Coordination Network (финансируемой NSF) начала открытый процесс разработки консенсусных стандартов (Agricultural Microbiomes Metadata Standards). Они предложили предварительный чек-лист обязательных и желательных метаданных для обсуждения научным сообществом.

Следующие шаги

После сбора обратной связи планируется разработать официальный стандарт MIxS-Ag в сотрудничестве с Консорциумом геномных стандартов (Genomic Standards Consortium, GSC). Этот стандарт будет интегрирован в коллекцию GSC MIxS и распространен на популярных платформах для управления данными.

Процесс разработки продолжается с активным привлечением отзывов от исследователей из различных публичных и частных секторов.

2020-03-25