Бактериальное сообщество внутри корня растения

Исследователи из Института селекции растений и Морской микробиологии Общества Макса Планка обнаружили, что модельное растение Arabidopsis избирательно формирует уникальное бактериальное сообщество в своих корнях из невероятного разнообразия почвенных микроорганизмов.

Ключевые выводы

  • Растение специфически выбирает три основные группы (филумы) бактерий для заселения корневой ткани: Actinobacteria, Proteobacteria и Bacteroidetes.
  • Состав этого микробного сообщества зависит от типа почвы и генотипа растения.
  • Исследование показало, что один вид бактерий может встречаться в десять раз чаще в одном экотипе Arabidopsis по сравнению с другим.
  • Более 40% бактерий в корне относятся к группе, которая встречается как на живых корнях, так и на мертвом органическом материале.

Детали исследования

Ученые провели "перепись" бактерий в трех средах:

  1. Ткань корня с резидентными бактериями.
  2. Ризосфера (почва, непосредственно прилегающая к корню).
  3. Невозделанная почва вокруг тестовых растений.

Растения выращивали в двух типах почв:

  • Суглинистая, илистая почва из Кёльнской низменности.
  • Песчаная почва из речного и озерного ландшафта вокруг Гольма (Бранденбург).

Научные вопросы и гипотезы

Результаты указывают на активный, а не случайный процесс отбора бактерий растением:

  • Для преобладающих в живом корне Actinobacteria, по словам руководителя исследования Петера Шульце-Леферта, должен существовать молекулярный "пригласительный билет".
  • Ключевой вопрос: как иммунная система растения отличает полезные бактерии от патогенов (друзей от врагов) и толерантно к ним относится, в то время как против патогенных захватчиков она действует быстро и агрессивно.
  • Предполагается, что бактерии, общие для живых корней и мертвого материала, привлекаются специфическими компонентами клеточной стенки растения, которые идентичны в обоих случаях.

Подобная избирательная концентрация специфических бактерий в корне наблюдается и при сравнении диких растений Arabidopsis с выращенными в теплице.