Прорыв в анализе липидов: новый софт LipidCreator ускоряет исследования

Международная команда под руководством Роберта Арендса с факультета химии Венского университета представила в журнале Nature Communications революционный инструмент для эффективного анализа липидов. Их программное обеспечение LipidCreator значительно ускоряет анализ специфических групп липидов и липидных сигнальных молекул, позволяя проводить их качественную и количественную характеристику с помощью масс-спектрометрии. Учёные успешно применили новый метод для анализа компонентов крови.

Липиды как многофункциональные биомаркеры

Липиды, такие как жиры крови или участники свёртывания, обладают большим потенциалом в качестве биомаркеров. Они формируют клетки и органеллы, передают информацию, защищают организмы и служат энергетическими блоками. "Ещё недавно мы только начинали понимать всё разнообразие функций липидов", — отмечает биохимик Роберт Арендс, профессор липидомики (анализа всех липидов клетки, ткани или организма).

Возможности LipidCreator

Инновационное ПО LipidCreator выводит липидомику на новый уровень:

  • Позволяет учёным создавать новые целевые анализы в липидомике.
  • Делает эти анализы легко доступными для других лабораторий.
  • Служит онлайн-базой данных для липидных исследований, позволяя получать и включать в работу обширные знания из других исследований.

На основе этого софта исследователи теперь могут:

  • Количественно определять около 60 классов липидов и их сигнальных молекул в гораздо более масштабных исследованиях, чем раньше.
  • Быстро настраивать рабочие процессы для анализа новых целевых молекул.
  • Легко проверять и валидировать результаты.

Преодоление сложностей анализа

Липиды химически очень разнообразны, имеют сложную структуру и состоят из комбинаций строительных блоков (сахара, ацильные группы, различные типы связей). Хотя масс-спектрометрия (MS) стала быстрее и чувствительнее, а её специальные модификации позволяют идентифицировать до 500 липидов, до сих пор не хватало комплексных программных решений для целевого масс-спектрометрического анализа конкретных групп липидов.

Клиническое применение

Команда Арендса уже применила своё ПО, доказав его высокий потенциал для клинических задач. Липиды в различных формах — важные источники энергии, транспортируемые в крови. Как ключевые факторы передачи сигналов между клетками, они участвуют в активации тромбоцитов, важных для свёртывания крови.

С помощью LipidCreator учёные успешно:

  1. Охарактеризовали липиды в плазме крови.
  2. Проанализировали роль липидов в активации тромбоцитов.

По мнению исследователей, данные, полученные в результате таких исследований, могут даже помочь выявить важные факторы для свёртывания крови и развития тромбоза.

2020-04-29