Кровь животных из зоопарка помогает предсказывать болезни у людей

Биоинформатики и генетики из Саарского университета использовали образцы крови животных из зоопарков Саарбрюккена и Нойнкирхена для поиска биомаркеров ранней диагностики заболеваний. Вместо тканей пациентов они проанализировали кровь 21 животного (19 видов), включая пингвина Гумбольдта и носуху.

Ключевой метод — микро-РНК

Исследователи во главе с профессором Андреасом Келлером сосредоточились на микро-РНК — коротких молекулах рибонуклеиновой кислоты, играющих важную роль в регуляции генов. Для их поиска применяются методы машинного обучения.

Эволюционный подход повышает точность

Основная проблема при работе с человеческими данными (до 20 млн точек на пациента) — сложность для ИИ в определении, какие паттерны биомаркеров являются истинными. Биомаркеры, эволюционно консервативные (встречающиеся у разных видов), с гораздо большей вероятностью являются надёжными. Анализ крови животных помогает отфильтровать такие устойчивые биомаркеры.

Результаты и доступность

Полученные данные интегрируются в компьютерные модели для более точной идентификации биомаркеров таких заболеваний, как рак лёгких, Альцгеймер и Паркинсон. Результаты опубликованы в журнале Nucleic Acids Research, а созданная база данных, включающая уже 40 животных (например, анаконду и кенгуру), открыта для учёных worldwide. Проект поддержан правительством земли Саар.