Инженерия клеток для более эффективного производства биотоплива

Тяжёлые спирты, такие как изобутанол, — перспективные кандидаты на замену бензину. Они содержат больше энергии, чем этанол, и лучше совместимы с существующей инфраструктурой. Чтобы сделать их производство практичным, нужен способ получать большие количества из возобновляемых источников.

Инженеры-химики и биологи MIT нашли способ резко увеличить производство изобутанола в дрожжах, которые естественным образом производят его в малых количествах. Они модифицировали дрожжи так, чтобы синтез изобутанола происходил полностью внутри митохондрий — клеточных структур, генерирующих энергию и содержащих множество биосинтетических путей. Этот подход позволил увеличить производство изобутанола примерно на 260%.

Хотя этого ещё недостаточно для промышленного масштаба, прогресс показывает, что подход перспективен для конструирования не только изобутанола, но и других полезных химикатов, отмечает профессор Грегори Стефанопулос, соавтор статьи в Nature Biotechnology.

Перемещение метаболического пути

Обычно дрожжи производят изобутанол в серии реакций в двух разных частях клетки:

  1. Синтез начинается с пирувата в митохондриях, где образуется предшественник альфа-кетизовалерат (альфа-KIV).
  2. Затем альфа-KIV транспортируется в цитоплазму, где другой набор ферментов превращает его в изобутанол.

Ранее исследователи пытались экспрессировать все ферменты для синтеза в цитоплазме. Учёные MIT пошли противоположным путём: они переместили вторую фазу пути из цитоплазмы в митохондрии. Это было достигнуто путём добавления к ферментам специальной метки, направляющей их в митохондрии.

Помимо увеличения выхода изобутанола на 260%, производство родственных спиртов — изопентанола и 2-метил-1-бутанола — выросло ещё сильнее: на 370% и 500% соответственно.

Причины повышения эффективности

Исследователи предполагают несколько причин такого роста:

  • Кластеризация ферментов в ограниченном пространстве митохондрий повышает вероятность протекания реакций.
  • Ферменты второй фазы в митохондриях эффективнее конкурируют за ограниченный запас предшественников с другими метаболическими путями, чем когда они находятся в цитоплазме.

Это открытие может иметь широкое применение в метаболической инженерии, так как локализация всех этапов реакции в малом пространстве может не только повысить эффективность, но и предотвратить утечку вредных промежуточных продуктов.

Следующие шаги

Сейчас учёные работают над дальнейшим увеличением выхода изобутанола и сокращением производства этанола, который остаётся основным продуктом расщепления сахара в дрожжах.

«Подавление пути синтеза этанола — важный шаг к пригодности этих дрожжей для производства изобутанола», — говорит Стефанопулос.

Исследование финансировалось Национальными институтами здоровья (NIH) и Shell Global Solutions.

2013-02-18