Создана первая публичная коллекция бактерий из кишечника мышей

Мышиные модели широко используются в фармацевтических и медицинских исследованиях. Известно, что сообщества микробов в их кишечнике могут значительно влиять на результаты исследований. Однако информации о многих бактериях, населяющих кишечник мышей, все еще недостаточно. Впервые коллекция культивированных бактериальных штаммов предоставляет комплексные данные о микробиоте кишечника мышей: ученым из Технического университета Мюнхена удалось выделить, охарактеризовать и архивировать сто штаммов, включая 15 ранее неизвестных таксонов.

76 культивированных видов бактерий идентифицированы и архивированы

Ключом к получению информации о взаимодействии кишечных бактерий с организмом-хозяином являются мышиные модели. Однако до сих пор лишь горстка мышиных кишечных бактерий была общедоступна и полностью охарактеризована. Это серьезно ограничивает исследования, поскольку затрудняет аннотацию данных, полученных молекулярными методами. Ученые во главе с д-ром Томасом Клавелом из Центрального института исследований питания и пищевых продуктов (ZIEL) описывают в журнале "Nature Microbiology" новый ресурс, который впервые содержит сто культивированных бактериальных штаммов из микробиома кишечника мыши. Для этого исследования было изучено 1500 культур, идентифицировано и заархивировано 76 различных видов.

Целью работы был значительный шаг к расшифровке культивируемой части бактериальных сообществ кишечника мышей. Около 20% штаммов в коллекции предпочитают колонизировать именно кишечник мышей, что подчеркивает специфичность микробиома.

Новые бактерии со специфическими функциями

Впервые исследователям удалось охарактеризовать новые бактерии с важными функциональными свойствами. Например, Flintibacter butyricum производит короткоцепочечную жирную кислоту бутират как из сахаров, так и из белков — редкое свойство среди кишечных бактерий. Бутират является основным продуктом ферментации в кишечнике и, как показали многочисленные исследования, обладает противовоспалительным действием и положительно влияет на течение метаболических заболеваний.

Публично доступная база данных культивированных кишечных бактерий мышей и их генетического материала приближает ученых к лучшему пониманию взаимодействий микробов с хозяином и повышению степени стандартизации в доклинических исследованиях.