Взаимодействия между бактериями кишечника могут ограничивать эффективность антибиотиков против C. difficile

Исследование, опубликованное 11 мая в PLOS Biology, предполагает, что межвидовые взаимодействия в рамках микробиома кишечника могут влиять на эффективность антибиотиков, направленных на лечение инфекций, вызываемых бактерией Clostridioides difficile (C. difficile).

Инфекции C. difficile возникают в контексте сложных резидентных сообществ кишечника. Однако антибиотики для их лечения разрабатываются на основе восприимчивости бактерии к препаратам в монокультуре, без учёта её взаимодействий с другими бактериями.

Чтобы лучше понять изменяющие восприимчивость микробные взаимодействия, исследователи провели эксперименты по тестированию эффективности двух антибиотиков — ванкомицина и метронидазола — в разнообразном сообществе человеческого кишечника. Для выявления экологических принципов, лежащих в основе межвидовых взаимодействий, они построили вычислительную модель.

Результаты исследования:

• Бактериальные виды, более восприимчивые к тестируемым антибиотикам, чем C. difficile, позволяют последнему расти в отсутствие экологической конкуренции.
• Эти виды увеличивают численность C. difficile в присутствии сублетальных концентраций метронидазола.
• Присутствие конкретного вида бактерий — Desulfovibrio piger — делает C. difficile толерантным к метронидазолу.

Исследование было ограничено только двумя антибиотиками, поэтому будущие работы должны быть сосредоточены на том, как межвидовые взаимодействия могут влиять на эффективность других клинически значимых препаратов.

По словам авторов, их работа демонстрирует, что рост патогена может изменяться межвидовыми взаимодействиями в широком диапазоне концентраций антибиотиков, что следует учитывать при разработке антибиотикотерапии.