Новый инструмент для выявления исчезающих экосистем
Исследователи из Universidad Politécnica de Madrid, University Centre for Digital Art and Technology и Universidad Francisco de Vitoria разработали новый инструмент визуализации двудольных биологических сетей (например, связей опылителей и растений или болезней и генов). Он помогает анализировать взаимодействия и прогнозировать корректирующие меры.
BipartGraph — это инструмент визуализации данных, который позволяет учёным прогнозировать, какие виды флоры и фауны находятся под угрозой исчезновения, разрабатывать корректирующие меры и предсказывать последствия изменений в естественных экосистемах.
Инструмент полезен для экологов, которым требуются более наглядные и количественные результаты анализа экологических взаимодействий. Например, пользователь может определить виды растений, которым угрожает исчезновение их опылителей. Это важная задача, учитывая десятки видов и сотни взаимодействий.
Важность вида связана с его положением в сети. Исчезновение ключевых видов может вызвать трагический "каскадный эффект", приводящий к исчезновению как растения, так и его опылителей.
В работе представлены два новых типа визуализации на основе теории графов:
- Polar Plot — сводит информацию о новых величинах в один график.
- Ziggurat Plot — обеспечивает лучшее представление о связности благодаря пространственной группировке.
Экологи уже используют это свободное программное обеспечение для выявления видов, находящихся под угрозой из-за изменения климата, нехватки воды или разрушения мест обитания. Программу также можно применять в других областях, например, в биотехнологии, для изучения сетей наследственных заболеваний и вызывающих их генов.
Это программное обеспечение с открытым исходным кодом, написанное на языке "R", доступно для всего научного сообщества по адресу: github.com/jgalgarra/bipartgraph.
Подобные разработки показывают, как цифровизация, большие данные, аналитика и интерактивные инструменты визуализации способствуют научному прогрессу и имеют прямое применение для сохранения окружающей среды.