Новый инструмент помогает в инженерии стволовых клеток для медицинских исследований

Исследователь из клиники Майо и его коллеги разработали онлайн-аналитический инструмент, который ускорит и улучшит процесс перепрограммирования клеток для биомедицинских исследований. CellNet — это бесплатная интернет-платформа, использующая методы сетевой биологии для помощи в инженерии стволовых клеток. Подробности о CellNet и его применении описаны в двух статьях в журнале Cell.

Этот бесплатный инструмент имеет широкий спектр применений для всех типов клеточных исследований и может помочь в работе с различными типами рака. CellNet показывает, насколько близко созданная клетка напоминает свою естественную версию, и даже предлагает способы корректировки процесса.

Платформа содержит данные о широком спектре клеток и детали о том, что известно об этих типах клеток. Она применима практически к любому исследованию и позволяет пользователям совершенствовать процесс инженерии. В долгосрочной перспективе это обеспечит надежный путь к ранним фазам разработки лекарств, персонализированной терапии рака и фармакогенетике.

Как работает CellNet:

• Использует данные о 21 типе клеток и тканей из 56 опубликованных исследований по инженерии клеток человека и мыши.
• Анализирует и предсказывает судьбу клеток и соответствующие стратегии инженерии.
• Предоставляет классификационные оценки для определения дифференцировки и конверсии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток.
• Выявляет неполную конверсию созданных макрофагов и гепатоцитов.
• Позволяет исследовать судьбу клеток после профилирования экспрессии генов, классифицируя данные по типу клеток, оценивая статус генных регуляторных сетей и выявляя регуляторы, влияющие на процесс.

Это особенно ценно для прогнозирования успеха трансплантации опухолей в моделях мышей для исследований рака и разработки лекарств.

Доступ: Платформа доступна по адресу cellnet.hms.harvard.edu.