ИИ-инструмент с открытым исходным кодом ускорит разработку лекарств

Исследователи из Виргинского технологического университета представили новый инструмент искусственного интеллекта ProRNA3D-single, который значительно точнее предсказывает и визуализирует трёхмерные структуры комплексов РНК с белками. Разработка опубликована в журнале Cell Systems.

ChatGPT для биологии

Инструмент использует два больших языковых модели (LLM) — для белковых и для РНК-последовательностей — и создаёт третью модель, которая позволяет им «общаться» друг с другом.

«Это нейронное объединение двух разных больших языковых моделей, ведущее к двуязычному рассуждению», — пояснил руководитель исследования, доцент Дебсвапна Бхаттачарья.

В результате ProRNA3D-single генерирует детальные 3D-модели взаимодействия вирусной РНК с белками организма, что раньше было крайне сложной задачей даже для передовых ИИ-моделей, таких как разработки Google DeepMind.

Применение в медицине

Точное моделирование взаимодействий белок–РНК в 3D критически важно для:

• Понимания, как вирусы (например, SARS-CoV-2) связываются с белками человека.
• Разработки препаратов, блокирующих эти взаимодействия и предотвращающих инфекции.
• Исследования механизмов нейродегенеративных заболеваний, таких как болезнь Альцгеймера.

«Метод полностью универсален. Он не привязан к конкретному типу вируса или семейству вирусов», — отметил Бхаттачарья.

Открытая наука

Инструмент разрабатывался в течение двух лет и теперь доступен как открытое программное обеспечение. Исследователи подчёркивают важность открытой науки, финансируемой за счёт налогоплательщиков.

«Мы осознаём, что проблема далека от решения. Мы добились прогресса, но у этих моделей ещё долгий путь», — заключил Бхаттачарья.