Открытие новых генов-мишеней для борьбы с устойчивыми бактериями
Учёные из Буффало обнаружили ранее неизвестный набор генов, необходимых для роста потенциально смертельных, устойчивых к лекарствам бактерий A. baumannii. Исследование, опубликованное в журнале mBio, не только выявляет новые мишени для лекарств, но и ставит под сомнение стандартные методы поиска таких мишеней в богатых лабораторных средах.
Проблема A. baumannii
- Грамотрицательная бактерия A. baumannii вызывает растущее число внутрибольничных инфекций по всему миру.
- Она опасна для пациентов с тяжёлыми заболеваниями, пожилых людей и перенёсших операции.
- Многие штаммы устойчивы почти ко всем антимикробным препаратам, а новые лекарства против неё не разрабатываются.
Новый подход к поиску генов
Традиционно гены, необходиме для жизни патогенов, ищут, выращивая бактерии в оптимальных лабораторных условиях. Однако исследователи решили изучить, что нужно A. baumannii для роста в условиях, имитирующих инфекцию в организме человека.
- Метод: Проведён генетический скрининг для выявления генов, абсолютно необходимых для роста и выживания A. baumannii в человеческом асците — патологической перитонеальной жидкости.
- Результат: Обнаружено 18 таких генов. Практически ни один из них не был ранее определён как существенный в Database of Essential Genes (DEG), поскольку они не требовались для роста в идеальной лабораторной среде.
Значение открытия
- Новые мишени для лекарств: Выявленные гены представляют собой новые, высокоценные цели для разработки препаратов против инфекций, вызванных A. baumannii.
- Широкий спектр действия: Вычислительные модели показывают, что эти гены, вероятно, консервативны и у других грамотрицательных инфекций. Это означает, что новые лекарства на их основе могут быть эффективны и против других устойчивых патогенов.
- Критика метода: Исследование указывает, что типичные методы изучения бактерий в богатых лабораторных средах могут быть не лучшим способом идентификации остро необходимых антимикробных мишеней.
В настоящее время научная группа занимается поиском новых антибактериальных препаратов, нацеленных на эти недавно идентифицированные бактериальные мишени.