Расшифрован геном вымерших финиковых пальм, проросших из 2000-летних семян

Учёные из Центра геномики и системной биологии Нью-Йоркского университета в Абу-Даби успешно секвенировали геном ранее вымерших разновидностей финиковой пальмы (Phoenix dactylifera L.), живших более 2000 лет назад.

Метод исследования

• Для анализа использовали семена, найденные на археологических памятниках в южном Леванте и датированные радиоуглеродным методом периодом с IV века до н.э. по II век н.э.
• Семена прорастили, получив жизнеспособные растения.
• Провели полное секвенирование генома этих древних образцов. Это первый случай секвенирования генома растений из древних проросших семян.

Ключевое открытие

• В период с IV века до н.э. по II век н.э. финиковые пальмы Восточного Средиземноморья начали приобретать всё больше генов от другого вида — Phoenix theophrasti (современный ареал: Крит, другие греческие острова и юго-запад Турции).
• Это результат гибридизации между видами. Учёные связывают рост доли генов P. theophrasti с усилением влияния Римской империи в регионе.

Значение работы

По словам профессора Майкла Д. Пуругганана, этот подход «воскрешающей геномики» эффективен для изучения генетики прошлых и вымерших видов. Проращивание древних семян позволяет не только изучать геномы утраченных популяций, но и заново открывать гены, которые могли исчезнуть у современных сортов.

Исследование опубликовано в журнале Proceedings of the National Academy of Science под названием «The genomes of ancient date palms germinated from 2,000-year-old seeds».